Google AI помогает определить самые сложные белковые узлы на данный момент

Google AI помогает определить самые сложные белковые узлы на данный момент

Особенно интересное явление возникает для белков, которые содержат топологический узел в своей полипептидной структуре, то есть белки, которые не распутываются полностью после того, как их вытягивают с обоих концов. За последние два десятилетия было идентифицировано всего около 20 различных семейств белков, содержащих узлы.

Тем не менее, узловатые белки представляют собой проблему для фолдинга и эволюции белков. Поскольку она существенно способствует, среди прочего, пониманию многих заболеваний и их лечения, эта информация о так называемом «сворачивании» белков пользуется большим спросом. Эти факторы привели к созданию AlphaFold, искусственного интеллекта, который предсказывает трехмерные структуры.

Usando esta IA, uma equipe de pesquisa incluindo Исследователи da Universidade Johannes Gutenberg Mainz (JGU) e da Universidade da Califórnia, Los Angeles, observou de perto essas estruturas e as examinou em relação aos nós.

Маартен А. Бремс, доктор философии. студентка группы Dr. Питер Вирнау из Университета Майнца сказал: «Мы численно исследовали все — а это около 100.000 XNUMX — предсказаний AlphaFold для новых белковых узлов. Цель состояла в том, чтобы идентифицировать редкие высококачественные структуры, содержащие сложные и ранее неизвестные белковые узлы, чтобы обеспечить основу для экспериментальной проверки предсказаний AlphaFold. В ходе исследования был обнаружен самый сложный на сегодняшний день узелковый белок и первые узлы, превращенные в белки. Последний можно представить как два отдельных узла на одной веревке».

Роберт Ранкель, физик-теоретик, участвовавший в проекте, сказал:

«Эти результаты также дают представление об эволюционных механизмах, стоящих за этими редкими белками».

Др. Петер Вирнау доволен результатами: «Мы уже наладили сотрудничество с нашим коллегой Dr. Тодд Йейтс из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе, чтобы экспериментально подтвердить эти структуры. Это направление исследований сформирует взгляд биофизического сообщества на искусственный интеллект, и нам повезло, что в нем участвует такой эксперт, как Тодд Йейтс».

Ссылки на журналы:

    М. Бремс и др., AlphaFold предсказывает наиболее сложные белковые узлы и составные белковые узлы Protein, Protein Science 31:8, 13 июля 2022 г. DOI: 10.1002/pro.4380
  • Дж. Джампер и др., Высокоточное предсказание структуры белка с помощью AlphaFold, Nature 596, 583-589, 15 июля 2021 г. DOI: 10.1038/s41586-021-03819-2
  • Похожие сообщения

    Оставить комментарий

    ошибка: